お世話になります。
この件はもともとこちらに落ち度があることで、通常起こり得ることではなく不具合とは意味合いが異なるとは思います。

【現象】
カテゴリの登録件数が実際と合わない
→実際の登録件数と表示が合わない例

【やった(やらかした)こと】
1. myalbum-pで運用していた頃に誤ってuploadsフォルダの中身を全部消してしまい、その後の復旧で登録内容とファイルの整合が判らなくなっていたために1からファイルを登録し直したおかげで、ファイルidとファイル名が一致しなくなった
(idとファイル名の不整合はそれ以外にも原因があったかもしれませんが今となっては検証不能)
2. webphotoへインポート後、サムネイルの再構築(exifの再取得)で1.の問題が顕在化して運用上不都合になったため、dbを直接書き換えてファイルidを1から振り直した
3. 調子に乗ってカテゴリidに飛び番が生じていたのを解消しようと、これも1から振り直した

使用ツール:phpMyAdmin 2.11.1

ただ、3.の後につくったカテゴリでも件数の不整合はおきているのが理解に苦しむところではあります。
→例

dbのどこかに件数が格納されている(ゴーストが残っている?)と思いwebphotoのテーブル内を探してみましたが、それらしきものは見当たらないようですし、お知恵を拝借できると幸いです。

自己レス恐縮です。

やはりゴーストが発生していたようです。まったく偶然にですがようやく問題を起こしている箇所を突き止めました。

お目汚しお詫びします。

何をやったら直ったのかを書いておけば、他の人の役に立つのでは。

問題を起こしていたアイテムは、カテゴリで絞り込んで表示中のGoogleマップに、そのカテゴリに属さないアイテムが出て来たことで判明しました。

修正時にやったことは、これらは存在しないカテゴリidを参照していましたので、[アイテム・テーブル管理]で所望のカテゴリidに訂正しただけです。

生兵法を露呈した格好でお恥ずかしい限りです。

引用：

それは変だな！
カテゴリに属さないのであれば、Googleマップに出ないはずだが。

引用：

カテゴリの修正であれば、編集画面から出来ると思うが。


weblink では ゾンビテストと称して、
アイテムとカテゴリの関連付けを検査しています。
存在しないカテゴリ(ゾンビ)を参照していれば、警告が表示されます。
webphoto にも気が向いたら入れてみるか。

＞カテゴリに属さないのであれば、Googleマップに出ないはずだが。
確かにその通りと思い、改めてわざと存在しないカテゴリIDを指定してみました。
結果は再現せず自分でも理解に苦しむのですが、ゴーストの特定はGoogleマップに「そこにあるはずが無い」アイテムが出てきていなければできませんでしたし、それらアイテムには使われていないカテゴリIDが入っていました。一覧表示等でこれらにカテゴリは表示されておらず、「カテゴリなし」の扱いになっていたのです。

＞カテゴリの修正であれば、編集画面から出来ると思うが。
これについては「カテゴリなし」の扱いになっていたので、では何が入ってる(ことになっている)か?を見ようと興味本位にそちらを使ったに過ぎず、何か意図があったわけではありません。

引用：

他にも何かおかしいのかも？
現状 支障なければ、そのままでいいかも。